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各方势力大混杂，所有日本势力被归类到幻影城，来的熟人包括死屋之鼠、guild、dgss、时钟塔和standard。
guild和时钟塔都是远远看一眼然后守株待兔，dgss那边当然是哥嫂主动请命，standard里疯了一片，从担心战争再起的凡尔纳和纪德到对未知存在和高维理论痴迷不已的玛丽再到为中也状态着急的旗会，疯得多姿多彩又浑然一体，直往常暗里闯。
standard先到了新东京，勉强跟夏目漱石和谈，然后玛丽专注研究“书”
和高维存在，其他人前往幻影城。
去幻影城是为了打陀总，然而陀总出门找玛丽了，玛丽愉快反水（其实也不算，在她看来只是做了一项研究，就像战时研发壳一样，把它当能源还是武器都与她无关），陀总将福地晋升，然后开始打决战。
打得就跟文野主线一样绝望，直到脑回路清奇的哥找到大家都以为背叛了的玛丽，直接要求她给出高维的秘密。
玛丽爽快掏出自己的各种研究成果。
然后开始升维大战，大战中途陀总忽然停顿，他现实中的身体被以为不可能背叛的人杀死了，却没能及时转生——绫辻行人的异能转手又把背叛者杀了，因果律，无法判定是绫辻行人杀了陀总，程序卡了一下。
背叛者是立原道造，他投向陀总并非出于无奈或利益，而是在陀总身上看到了与他亲生兄长相近的气质，因而有虚假的兄弟纽带连接，陀总没有对他设置太多防备。
控制金属的能力又太方便刺杀。
程序卡了那么一下，卡尔玛升维成一堵墙，将陀总隔离在高维里，从此罪与罚的双关也圆满了，s·卡尔玛的剧情也完整了，决战也可以收工了。
剩下的就是常暗剧情篇。
从高维看常暗其实就是一种特殊的异能体，异能体的主人是年幼的孩子，在战争里孤苦无依地死去（具体情况类似于烨子），怨念凝结的异能珠体导致了常暗现象。
当年常暗岛之战的终结是某位异能者将异能体封入深海，然后那颗珠子被爱手艺捡到了，然后被当成礼物送给哥嫂了，然后超越者的力量激活乐珠子，常暗2.0就爆发了。
嫂：“……”
嫂让哥把行星上嵌的珠子拿下来，哥不情不愿地照做，嫂让中也把珠子转交给乱步。
乱步拿到珠子、得知常暗始末后沉默很久，最后在新东京立了两块碑，一块纪念逝者，一块反省战争。
常暗没有完全散去，只是消除了电磁。
想要恢复秩序，常暗反而是很好的保护和过渡。
夏目真正放下一切担子，把新东京交给了年轻一代，不知道去哪里隐居了。
乱步和中也告别，双向暗恋但还没扯明白过的两个人面面相觑，中也问以后还联系吗，乱步立刻说当然。
中也盯着他看，乱步辩解说至少还要告诉你叔叔阿姨的情况呢。
正文的最后就是乱步带着中也去见亲生父母，中也从法国出发前哥嫂又是一顿揉揉，近乡情怯的中也被乱步拉进屋子，然后陌生却温柔的中年夫妻流着眼泪抱住了自己经历过太多事情的孩子。
中也手忙脚乱的时候，乱步在旁边静静地看。
中也缓过神来之后察觉到乱步的异样，主动说想去探望乱步的家人。
乱步先是带他到纪念碑前献了一束花，然后才走到他成长的那个如今已经面目全非的小乡村里，找到那两座矮矮的墓碑。
乱步对爸爸妈妈说，放心，你们的笨蛋儿子现在也过得很满足。
中也握住了他的手，也对着墓碑鞠了一躬。
全文完。
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